genomika
genòmika, genetikos sritis, tirianti genus, jų sandarą, funkciją ir raišką. Genų skaičius genome skiriasi priklausomai nuo individo rūšies, pvz., žmogaus genome yra apie 20 000–25 000 baltymus koduojančių genų. Naujos kartos DNR sekoskaitos technologijų plėtojimasis, lėmęs DNR sekoskaitos proceso kainos ir trukmės sumažėjimą, paspartino genomikos tyrimų plėtrą. Įvykdyti ir vykdomi daugelio individų rūšių – įvairių bakterijų, grybų, augalų, gyvūnų ir virusų – genomikos projektai.
Genomikos tyrimai apima viso genomo, transkriptomo (koduojančių genomo regionų), epigenomikos ir funkcinės genomikos tyrimus. Viso genomo sekoskaita yra organizmo genomo DNR sekos nustatymas. Tai atliekama įvairiomis strategijomis taikant skirtingus metodus ir technologijas. Viso genomo sekoskaita suteikia galimybę sudaryti baigtinį organizmo genolapį, kuris svarbus organizmo biologijos supratimui. Transkriptomas apima baltymus koduojančią ir su ja susijusią organizmo genomo dalį, kuriai priskiriamos informacinės, pernašos, ribosominės ir kitos RNR molekulės. Tiriant organizmo transkriptomą nuo RNR yra sintetinama jai komplementari DNR molekulė (kDNR), kuri toliau tiriama mikrolustų arba sekoskaitos metodais. Transkriptomo tyrimai leidžia suprasti skirtingų ląstelių tipų struktūrą ir funkciją, kaip pokyčiai genome lemia organizmo ligas. Epigenomika tiria genų raiškos kintamumą, kuris nesusijęs su nukleotidų, sudarančių DNR, sekos pokyčiais (pvz., DNR metilinimo, histonų deacetilinimo procesai). Epigenetiniais tyrimais yra įvertinama aplinkos veiksnių (pvz., mitybos, streso) įtaka genomo įspaudui, t. p. jo paveldėjimui.
Epigenomikos žinios taikomos daugelyje biologijos sričių, nuo augalų sėklų ir gyvūnų produkcijos iki žmogaus sveikatos. Funkcinė genomika tiria genų funkciją, jų tarpusavio sąveiką ir sąveiką su aplinkos veiksniais. Genetiniai reiškiniai ir procesai (pvz., RNR interferencija ar mutagenezė) tiriami įvairiais analizės metodais. Funkcinės genomikos tyrimai dažniausiai atliekami naudojant modelinius organizmus. Šiais tyrimais siekiama nustatyti genotipo ir fenotipo ryšio struktūrą.
2945
-genomas; -transkriptomas; -epigenomika