žmogaũs koronavrusai, Coronaviridea šeimos, Orthocoronovirinae pošeimio virusai, sukeliantys žmogaus infekcines ligas. Daugiausia sukelia vadinamąsias peršalimo ligas, kurių simptomai – karščiavimas, gerklės skausmas, kosulys. Jie t. p. gali sukelti bronchitą ir plaučių uždegimą. Šiuo metu žinomi 7 žmogaus koronavirusai: žmogaus koronavirusas 229E, žmogaus koronavirusas OC43, žmogaus koronavirusas NL63, žmogaus koronavirusas HKU1, SŪRS (angl. SARS) koronavirusas, ARRS (angl. MERS) koronavirusas, naujasis 2019 koronavirusas. Žmogaus koronavirusai 229E, NL63, OC43 ir HKU1 nuolat cirkuliuoja populiacijoje ir sukelia palyginti nesunkias viršutinių kvėpavimo takų infekcijas suaugusiesiems ir vaikams, ypač žiemą ir ankstyvą pavasarį. SŪRS, ARRS koronavirusai ir naujasis 2019 koronavirusas yra pavojingesni, jų protrūkiai nusinešė nemažai žmonių gyvybių.
naujojo 2019 koronaviruso molekulinis modelis
SŪRS koronavirusas
SŪRS (sunkaus ūmaus respiracinio sindromo), arba SARS (angl. Severe acute respiratory syndrome), koronavirusinės infekcijos protrūkis prasidėjo 2002 lapkritį Pietų Kinijoje ir truko iki 2003 birželio. Iš viso buvo užregistruoti 8098 SŪRS atvejai 17 šalių, daugiausia Kinijoje ir Honkonge. Mirtingumas nuo SŪRS siekė 9,6 % – mirė iš viso 774 susirgusieji. 2003 balandį buvo iššifruotas pilnas 29,7 kilobazių ilgio SŪRS koronaviruso genomas. Genome yra 13 genų, kurie koduoja 14 viruso baltymų. Tai koronavirusams būdingi baltymai (replikazė, proteazė, S, M, E ir N baltymai) ir dar 8 pagalbiniai baltymai, kurių funkcijos nežinomos. 2017 įrodyta SŪRS viruso zoonotinė kilmė – virusas buvo aptiktas civetose (Paguma sp.), t. p. panašūs į SŪRS virusai buvo aptikti Kinijos šikšnosparniuose. Infekuoti gyvūnai neturėjo jokių ligos požymių. Šių koronavirusų filogenetinė analizė parodė, kad SŪRS koronavirusas yra kilęs iš šikšnosparnių, o žmonės juo užsikrėtė Kinijos turguose arba tiesiai nuo šikšnosparnių, arba per kitus šį virusą nešiojančius gyvūnus.
SŪRS simptomai primena gripą – tai karščiavimas (kūno temperatūra pakyla daugiau kaip 38 °C), raumenų, gerklės skausmai, kosulys. Ligai progresuojant gali vystytis plaučių uždegimas ir kvėpavimo nepakankamumas. SŪRS virusas perduodamas oro lašiniu būdu ir pirmiausia infekuoja kvėpavimo takų gleivinę. Nors kai kuriems ligoniams SŪRS gali pasireikšti ir viduriavimu, nėra įrodymų, kad virusas plistų per išmatas. SŪRS viruso infekcijos inkubacinis periodas yra vidutiniškai 4–6 d., jis gali svyruoti nuo 1 iki 14 dienų. SŪRS protrūkį pavyko suvaldyti – nuo 2004 šios ligos atvejų pasaulyje neužregistruota.
ARRS koronavirusas
ARRS (Artimųjų Rytų respiracinio sindromo), arba MERS (angl. Middle East respiratory syndrome), koronavirusinės infekcijos protrūkis prasidėjo 2012 rugsėjį Saudo Arabijoje, iki 2013 spalio ten buvo užregistruota 124 ARRS atvejų, 52 susirgusieji mirė. Iki 2019 gruodžio pasaulyje užregistruoti 2468 ARRS koronaviruso infekcijos atvejai, iš kurių 851 baigėsi mirtimi. Mirtingumas nuo ARRS siekia 34,5 %. Daugiausia ARRS atvejų buvo užregistruota Saudo Arabijoje, Pietų Korėjoje, Jungtiniuose Arabų Emyratuose, Jordanijoje, Katare. Dar 19 šalių buvo užregistruoti pavieniai ARRS atvejai. 2012 lapkritį paskelbti duomenys apie ARRS koronaviruso genomą – jį sudaro S, E, M, N genai ir keletas nestruktūrinių baltymų genų. ARRS koronavirusas sunkiai perduodamas žmogaus žmogui, todėl jo plitimas ribotas. Manoma, ARRS koronavirusas yra kilęs iš šikšnosparnių, o žmonės juo užsikrėtė per kitus nešiotojus, tokius kaip kupranugariai (jų kraujuje buvo nustatyti neutralizuojantys antikūnai prieš ARRS koronavirusą, o nosiaryklės tepinėliuose aptiktos šiam virusui būdingos genų sekos). ARRS koronaviruso užkratas žmonėms galėjo patekti per kupranugarių šlapimą, kuris Vidurio Rytuose iki šiol dažnai vartojamas kaip liaudies medicinos priemonė įvairioms ligoms gydyti.
ARRS simptomai – karščiavimas, raumenų, gerklės, pilvo skausmai, vėmimas, viduriavimas. Ligai progresuojant gali vystytis plaučių uždegimas, kvėpavimo nepakankamumas, inkstų nepakankamumas, kraujo krešėjimo sutrikimai, perikarditas. ARRS viruso infekcijos inkubacinis periodas yra vidutiniškai 5,5 d., jis gali svyruoti nuo 1,9 iki 14,7 dienų.
SŪRS‑CoV‑2 koronavirusas
Naujojo 2019 koronaviruso (liet. SŪRS‑CoV‑2, angl. SARS‑CoV‑2, 2019‑nCoV) infekcijos, arba COVID‑19 (angl. Coronavirus Disease 2019), protrūkis prasidėjo Kinijos mieste Uhane, kuris yra septintasis pagal dydį Kinijos miestas (11 mln. gyventojų). 2019 gruodį šiame mieste buvo užregistruoti nežinomos kilmės plaučių uždegimo atvejai, jie buvo susieti su užkratu iš Huanano jūros gėrybių turgaus. 2020 01 12 buvo iššifruotas šio koronaviruso genomas, kuris yra 30 kilobazių ilgio ir 79,5 % sutampa su SARS koronaviruso genomu, apie 50 % – su MERS ir 96 % – su šikšnosparnių koronavirusų genomu. Remiantis šiais rezultatais, manoma, kad naujasis koronavirusas žmonėms pateko iš šikšnosparnių. Atlikus naujojo koronaviruso baltymų modeliavimo eksperimentus, nustatyta, kad viruso S baltymas specifiškai jungiasi su ACE2 baltymu ląstelėse. Tai rodo, kad ACE2 yra šio viruso receptorius, kuris padeda virusui patekti į ląstelę. Šis koronavirusas gali sukelti tiek lengvą, tiek sunkią infekcinę ligą – COVID‑19, kurios simptomai – karščiavimas, kosulys, silpnumas, viduriavimas, plaučių uždegimas, kvėpavimo nepakankamumas, inkstų nepakankamumas. Virusas perduodamas oro lašiniu būdu, ant plastiko, nerūdijančio plieno paviršiaus pavojingas išlieka iki 3 parų, ant medinių paviršių – iki 4 valandų.
peršvietimo elektroniniu mikroskopu gautas naujojo 2019 koronaviruso (SŪRS‑CoV‑2, arba SARS‑CoV‑2, 2019‑nCoV), išskirto iš sergančiojo COVID‑19, vaizdas. Viruso dalelės iškyla iš laboratorijoje auginamų ląstelių paviršiaus
Laikui bėgant SŪRS‑CoV‑2 virusas mutavo į daugiau kaip tūkstantį naujų atmainų (COVID‑19 atmainos), iš kurių svarbiausios alfa, beta, gama, delta, omikron atmainos.
SŪRS-CoV-2 koronaviruso infekcijos diagnostika
SŪRS‑CoV‑2 koronaviruso infekcijos diagnostikai naudojami molekuliniai ir serologiniai tyrimų metodai. PGR tyrimu (tikro laiko polimerazės grandinine reakcija, rt‑PCR), nustatomos tam tikros koronaviruso RNR sekos, kurios buvo parinktos iššifravus viruso genomą. Naudojant šį metodą koronavirusą galima aptikti kraujo mėginiuose arba nosiaryklės tepinėliuose (mėginius galima saugoti iki 3 parų 4 °C temperatūroje). Greituoju viruso antigenų testu per keliolika minučių galima nustatyti viruso antigenus ir patvirtinti virusinę infekciją, tačiau šio testo jautrumas gerokai mažesnis, palyginti su PGR tyrimu, todėl jis rekomenduojami tik esant ligos simptomams, kai viruso koncentracija yra didžiausia. Teigiamas greitasis testas patvirtina SŪRS-CoV-2 infekciją, tačiau neigiamas (dėl mažesnio jautrumo) jos neatmeta. Serologiniu antikūnų tyrimu nustatomi antikūnai prieš SŪRS-CoV-2. Persirgus COVID‑19 antikūnai atsiranda ne anksčiau kaip po 14 dienų, todėl šiuo testu galima patvirtinti buvusią SŪRS-CoV-2 infekciją ir imunitetą jai.
SŪRS‑CoV‑2 koronaviruso paplitimas pasaulyje
Pasaulio sveikatos organizacija 2020 01 30 dėl naujojo koronaviruso protrūkio paskelbė pasaulinę ypatingąją padėtį, 2020 03 11 – naujojo koronaviruso sukeltą pandemiją (COVID‑19 pandemija).
Iki 2020 02 04 užregistruota 20 604 infekcijos atvejai, iš jų 20 416 atvejų – Kinijoje; apie penktadalis infekcijos atvejų buvo sunkūs. Mirtingumas nuo šios infekcijos 2–3 %. Iki 2020 02 03 užregistruota 427 mirties atvejų.
Iki 2020 11 24 16 val. užregistruota 59 692 584 infekcijos atvejai 218 šalių, iš jų 12 780 398 – JAV, 9 181 163 – Indijoje, 6 088 004 – Brazilijoje, 2 144 660 – Prancūzijoje, 2 138 828 – Rusijoje, 1 606 905 – Ispanijoje, 1 527 495 – Jungtinėje Karalystėje, 1 431 795 – Italijoje, 1 374 631 – Argentinoje, 1 254 979 – Kolumbijoje, 1 049 358 – Meksikoje, 950 557 – Peru. Iki 2020 11 24 16 val. užregistruota 1 405 292 mirties atvejai, 41 294 232 ligoniai pasveiko.
2020 gruodžio mėnesį pradėtas masinis gyventojų skiepijimas COVID‑19 vakcina Jungtinėse Amerikos Valstijose, Izraelyje, Rusijoje, gruodžio 27 dieną – visoje Europos Sąjungoje, 2021 sausio mėnesį – Indijoje. Nuo 2020 gruodžio įvairiose pasaulio šalyse (nuo 2021 vasario ir Lietuvoje) pradėta rutininė SŪRS-CoV-2 viruso genomo sekoskaita.
Iki 2021 01 07 17 val. užregistruota 87 799 708 infekcijos atvejai 218 šalių, iš jų 21 865 323 – JAV, 10 395 938 – Indijoje, 7 874 539 – Brazilijoje, 3 332 142 – Rusijoje, 2 836 801 – Jungtinėje Karalystėje, 2 705 618 – Prancūzijoje, 2 283 931 –Turkijoje, 2 201 945 – Italijoje, 1 982 544 – Ispanijoje, 1 848 621 – Vokietijoje, 1 719 771 – Kolumbijoje, 1 676 171 – Argentinoje. Iki 2021 01 07 17 val. užregistruota 1 894 534 mirties atvejai, 63 277 842 ligoniai pasveiko.
Iki 2021 09 01 17 val. užregistruota 218 739 556 infekcijos atvejai 221 šalyje, iš jų 40 117 199 – JAV, 32 810 892 – Indijoje, 20 777 867 – Brazilijoje, 6 937 333 – Rusijoje, 6 789 581 – Jungtinėje Karalystėje, 6 765 708 – Prancūzijoje, 6 388 331 –Turkijoje, 5 185 620 – Argentinoje, 5 025 233 – Irane, 4 909 086 – Kolumbijoje, 4 855 065 – Ispanijoje, 4 539 991 – Italijoje. Iki 2021 09 01 17 val. užregistruota 4 537 862 mirties atvejai, 195 584 926 ligoniai pasveiko.
Iki 2022 03 22 16 val. užregistruota 473 002 961 infekcijos atvejis 225 šalyse ir teritorijose, iš jų 81 448 402 – JAV, 43 010 971 – Indijoje, 29 641 848 – Brazilijoje, 24 161 339 – Prancūzijoje, 20 319 434 – Jungtinėje Karalystėje, 19 017 693 – Vokietijoje, 17 637 795 – Rusijoje, 14 708 850 –Turkijoje, 13 895 188 – Italijoje, 11 324 637 – Ispanijoje, 9 936 540 – Pietų Korėjoje, 9 011 367 – Argentinoje. Iki 2022 03 22 16 val. užregistruota 6 107 323 mirties atvejai, 409 143 785 ligoniai pasveiko.
SŪRS‑CoV‑2 koronaviruso paplitimas Lietuvoje
Lietuvoje, siekiant suvaldyti koronaviruso grėsmes, Vyriausybė 2020 02 26 paskelbė valstybės lygio ekstremalią situaciją, 2020 03 16 – karantiną šalies mastu. Pirmas sergamumo pikas pasiektas 2020 04 20 (1047 infekcijos atvejai), nuo tada infekuotųjų skaičius mažėjo (2020 06 17 atšaukus karantiną jų buvo 259). 2020 07 04 fiksuota mažiausia infekcijos atvejų – 207. Nuo liepos vidurio užsikrėtusiųjų pradėjo daugėti. Nuo 2020 spalio antros pusės iki 2021 sausio 9 dienos buvo vis nustatoma daugiausia naujų koronaviruso infekcijos atvejų per parą (2020 10 20 patvirtinta 311, 2021 01 09 net 4646 nauji infekcijos atvejai), 2021 01 01 buvo daugiausia sergančiųjų COVID‑19 (71 286). Iki 2021 01 27 nustatyti 179 212 SŪRS‑CoV‑2 koronaviruso infekcijos atvejai (86 109 ligoniai pasveiko, 2076 mirė nuo COVID‑19). Dėl antros COVID‑19 protrūkio bangos nuo 2020 10 09 lokalus karantinas paskelbtas Raseinių rj. savivaldybės teritorijoje, nuo 2020 10 26 – dar 12 savivaldybių, nuo 2020 10 28 – dar 8 savivaldybių teritorijose. Nuo 2020 11 07 antrą kartą karantinas įvestas šalies mastu, nuo 12 16 karantino režimo sąlygos sugriežtintos, nuo 2020 12 27 prasidėjo gyventojų skiepijimas, nuo 2021 02 25 karantinas pradėtas švelninti, 07 01 atšauktas. Išplitus omikron atmainai pasiektas naujas susirgimų pikas – 2022 02 04 patvirtinti 13 116 nauji infekcijos atvejai. Lietuvoje iki 2022 03 22 nustatyti 997 690 SŪRS‑CoV‑2 viruso infekcijos atvejai (918 604 ligoniai pasveiko, 8751 mirė nuo COVID‑19).
774
-koronavirusas; -koronavirusai; -virusai; -COVID‑19; -SŪRS; -SARS; -ARRS; -MERS; -naujasis 2019 koronavirusas; -koronovirusas; -SŪRS‑CoV‑2; -SARS‑CoV‑2; -2019‑nCoV; -koronaviruso; -coronavirusas